Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms