Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms