Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms