Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ascl1Q02067 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms