Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Grin2cQ01098 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms