Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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SgcdP82347 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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