Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Irx2P81066 Gm26601-201ENSMUST00000181427 3551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms