Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ppfia3P60469 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ppfia3P60469 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms