Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf5P56477 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms