Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CartptP56388 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CartptP56388 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms