Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms