Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtpreP49446 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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PtpreP49446 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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