Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms