Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pde6aP27664 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms