Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clk1P22518 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Clk1P22518 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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