Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P20040 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P20040 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P20040 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P20040 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P20040 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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