Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms