Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxd4P10628 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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