Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P10404 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P10404 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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