Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Sp100O35892 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sp100O35892 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms