Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm28048F7BCN0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm28048F7BCN0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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