Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Zfp988F6VKC7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Zfp988F6VKC7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms