Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc8E9PWG2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms