Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms