Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms