Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Speer3W4VSP1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Speer3W4VSP1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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