Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rabgef1Q9JM13 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rabgef1Q9JM13 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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