Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Col5a3Q9JLI2 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Col5a3Q9JLI2 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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