Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn22Q9D7U6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms