Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem35aQ9D328 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem35aQ9D328 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms