Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PmpcbQ9CXT8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PmpcbQ9CXT8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms