Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PsenenQ9CQR7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms