Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Smim8Q9CQQ0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms