Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Commd4Q9CQ02 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Commd4Q9CQ02 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Commd4Q9CQ02 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms