Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ubqln4Q99NB8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms