Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PtprtQ99M80 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprtQ99M80 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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