Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hecw1Q8K4P8 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hecw1Q8K4P8 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms