Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Amigo3Q8C2S7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms