Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ttc29Q80VM3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc29Q80VM3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms