Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Uhrf2Q7TMI3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Uhrf2Q7TMI3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Uhrf2Q7TMI3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Uhrf2Q7TMI3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Uhrf2Q7TMI3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Uhrf2Q7TMI3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Uhrf2Q7TMI3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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