Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb3Q6XAS4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb3Q6XAS4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb3Q6XAS4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb3Q6XAS4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb3Q6XAS4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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