Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
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NipblQ6KCD5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
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NipblQ6KCD5 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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NipblQ6KCD5 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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NipblQ6KCD5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
NipblQ6KCD5 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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