Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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