Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Grik1Q60934 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Grik1Q60934 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Grik1Q60934 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Grik1Q60934 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Grik1Q60934 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Grik1Q60934 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Grik1Q60934 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms