Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atf3Q60765 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atf3Q60765 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atf3Q60765 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms