Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pdp2Q504M2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdp2Q504M2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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