Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trp53i11Q4QQM4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms