Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp48Q3V0C5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp48Q3V0C5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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