Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Srsf6Q3TWW8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms