Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpusd2Q149F1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms